Após efetuado um diagnóstico preciso da região acometida na coluna vertebral e das alterações responsáveis pela etiologia dos sintomas, a endoscopia de coluna é realizada por meio de incisões muito menores do que aquelas utilizadas nas cirurgias convencionais, com um diâmetro via regra inferior a 1 centímetro.
Após a punção direcionada da estrutura a ser abordada na coluna vertebral e a partir desta pequena incisão, são introduzidos os instrumentais cirúrgicos e um sistema de óptica por meio de cânulas, permitindo a visualização e resolução por vídeo das alterações presentes.
Na maioria dos casos, é possível realizar o procedimento apenas com sedação e anestesia local, sem a necessidade, portanto, de anestesia geral.